Dall’inizio degli anni 60, si è sviluppato il Centro Botanico del Giardino Esotico. Questa struttura, nella quale opera un’équipe di 7 giardinieri specializzati, riunisce un insieme di serre e tettoie che risponde a due scopi :
la moltiplicazione di una parte dei soggetti destinati ad essere ospitati nel Giardino o ad essere esposti in occasione dell’esposizione Floralies,
la conservazione di una collezione di riferimento di cactus e altre piante succulente che garantiscono la protezione «ex situ» di questi vegetali spesso rari e minacciati in natura.
Il Centro Botanico del Giardino Esotico di Monaco detiene un grande patrimonio continuamente arricchito, è la sede di una vera perizia nell'ambito della coltura e moltiplicazione delle piante succulente.
Ogni anno, viene pubblicata una lista delle sementi (“Index Seminum”) offerti in cambio a circa 500 giardini botanici in tutto il mondo. Sono migliaia di sacchetti di sementi che partono, ogni anno, a destinazione di una cinquantina di paesi.
Il Centro Botanico, chiuso al pubblico, è accessibile su richiesta ai centri scolastici e alle associazioni botaniche e di amatori di piante.